Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spc24Q9D083 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spc24Q9D083 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spc24Q9D083 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spc24Q9D083 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spc24Q9D083 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spc24Q9D083 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spc24Q9D083 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spc24Q9D083 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spc24Q9D083 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spc24Q9D083 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spc24Q9D083 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spc24Q9D083 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spc24Q9D083 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spc24Q9D083 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms