Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab3bQ9CZT8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3bQ9CZT8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab3bQ9CZT8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab3bQ9CZT8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rab3bQ9CZT8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rab3bQ9CZT8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab3bQ9CZT8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab3bQ9CZT8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms