Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Shmt2Q9CZN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Shmt2Q9CZN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shmt2Q9CZN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shmt2Q9CZN7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Shmt2Q9CZN7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Shmt2Q9CZN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shmt2Q9CZN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shmt2Q9CZN7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Shmt2Q9CZN7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms