Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Utp11Q9CZJ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Utp11Q9CZJ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Utp11Q9CZJ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Utp11Q9CZJ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Utp11Q9CZJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Utp11Q9CZJ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Utp11Q9CZJ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Utp11Q9CZJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Utp11Q9CZJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Utp11Q9CZJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms