Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cmtm6Q9CZ69 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cmtm6Q9CZ69 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cmtm6Q9CZ69 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtm6Q9CZ69 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtm6Q9CZ69 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cmtm6Q9CZ69 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cmtm6Q9CZ69 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cmtm6Q9CZ69 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms