Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmed5Q9CXE7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmed5Q9CXE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmed5Q9CXE7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed5Q9CXE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed5Q9CXE7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmed5Q9CXE7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmed5Q9CXE7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmed5Q9CXE7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmed5Q9CXE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmed5Q9CXE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmed5Q9CXE7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmed5Q9CXE7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmed5Q9CXE7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmed5Q9CXE7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms