Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc3Q9CXE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc3Q9CXE6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xrcc3Q9CXE6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xrcc3Q9CXE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Xrcc3Q9CXE6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Xrcc3Q9CXE6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Xrcc3Q9CXE6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms