Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc17Q9CXD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc17Q9CXD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc17Q9CXD9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrc17Q9CXD9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc17Q9CXD9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc17Q9CXD9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc17Q9CXD9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc17Q9CXD9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc17Q9CXD9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc17Q9CXD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms