Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX86

Hnrnpa0, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa0Q9CX86 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnrnpa0Q9CX86 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hnrnpa0Q9CX86 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hnrnpa0Q9CX86 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hnrnpa0Q9CX86 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hnrnpa0Q9CX86 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hnrnpa0Q9CX86 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hnrnpa0Q9CX86 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hnrnpa0Q9CX86 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hnrnpa0Q9CX86 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hnrnpa0Q9CX86 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hnrnpa0Q9CX86 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms