Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Utp23Q9CX11 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Utp23Q9CX11 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp23Q9CX11 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp23Q9CX11 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp23Q9CX11 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp23Q9CX11 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp23Q9CX11 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp23Q9CX11 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Utp23Q9CX11 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Utp23Q9CX11 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Utp23Q9CX11 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Utp23Q9CX11 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Utp23Q9CX11 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Utp23Q9CX11 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms