Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smurf1Q9CUN6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smurf1Q9CUN6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smurf1Q9CUN6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smurf1Q9CUN6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smurf1Q9CUN6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smurf1Q9CUN6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smurf1Q9CUN6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms