Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930553M12RikQ9CUH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930553M12RikQ9CUH1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930553M12RikQ9CUH1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930553M12RikQ9CUH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930553M12RikQ9CUH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4930553M12RikQ9CUH1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4930553M12RikQ9CUH1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930553M12RikQ9CUH1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms