Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sft2d3Q9CSV6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sft2d3Q9CSV6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sft2d3Q9CSV6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sft2d3Q9CSV6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sft2d3Q9CSV6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sft2d3Q9CSV6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms