Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Filip1Q9CS72 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Filip1Q9CS72 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Filip1Q9CS72 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Filip1Q9CS72 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Filip1Q9CS72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Filip1Q9CS72 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Filip1Q9CS72 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Filip1Q9CS72 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Filip1Q9CS72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Filip1Q9CS72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Filip1Q9CS72 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Filip1Q9CS72 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Filip1Q9CS72 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Filip1Q9CS72 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Filip1Q9CS72 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms