Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psmd9Q9CR00 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Psmd9Q9CR00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psmd9Q9CR00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Psmd9Q9CR00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psmd9Q9CR00 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmd9Q9CR00 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmd9Q9CR00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmd9Q9CR00 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms