Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc2Q9CQP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc2Q9CQP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc2Q9CQP2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc2Q9CQP2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trappc2Q9CQP2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trappc2Q9CQP2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trappc2Q9CQP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trappc2Q9CQP2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms