Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI4

Nwc, Uncharacterized protein C11orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NwcQ9CQI4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NwcQ9CQI4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NwcQ9CQI4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NwcQ9CQI4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NwcQ9CQI4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NwcQ9CQI4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NwcQ9CQI4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NwcQ9CQI4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NwcQ9CQI4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NwcQ9CQI4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NwcQ9CQI4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NwcQ9CQI4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NwcQ9CQI4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms