Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ergic3Q9CQE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ergic3Q9CQE7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ergic3Q9CQE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ergic3Q9CQE7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ergic3Q9CQE7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ergic3Q9CQE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ergic3Q9CQE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ergic3Q9CQE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ergic3Q9CQE7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms