Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prpf8Q99PV0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prpf8Q99PV0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prpf8Q99PV0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prpf8Q99PV0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf8Q99PV0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf8Q99PV0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prpf8Q99PV0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prpf8Q99PV0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Prpf8Q99PV0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prpf8Q99PV0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms