Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ino80bQ99PT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ino80bQ99PT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ino80bQ99PT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ino80bQ99PT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ino80bQ99PT3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ino80bQ99PT3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ino80bQ99PT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ino80bQ99PT3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ino80bQ99PT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ino80bQ99PT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ino80bQ99PT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80bQ99PT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ino80bQ99PT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ino80bQ99PT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ino80bQ99PT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ino80bQ99PT3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ino80bQ99PT3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ino80bQ99PT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ino80bQ99PT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ino80bQ99PT3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ino80bQ99PT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ino80bQ99PT3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms