Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GpnmbQ99P91 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GpnmbQ99P91 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GpnmbQ99P91 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GpnmbQ99P91 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GpnmbQ99P91 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GpnmbQ99P91 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GpnmbQ99P91 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GpnmbQ99P91 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GpnmbQ99P91 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GpnmbQ99P91 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GpnmbQ99P91 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GpnmbQ99P91 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GpnmbQ99P91 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GpnmbQ99P91 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GpnmbQ99P91 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GpnmbQ99P91 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GpnmbQ99P91 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GpnmbQ99P91 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GpnmbQ99P91 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GpnmbQ99P91 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GpnmbQ99P91 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GpnmbQ99P91 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GpnmbQ99P91 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GpnmbQ99P91 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms