Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp26Q99MX1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp26Q99MX1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp26Q99MX1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp26Q99MX1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp26Q99MX1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp26Q99MX1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp26Q99MX1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp26Q99MX1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp26Q99MX1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp26Q99MX1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp26Q99MX1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp26Q99MX1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp26Q99MX1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp26Q99MX1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp26Q99MX1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp26Q99MX1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp26Q99MX1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp26Q99MX1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp26Q99MX1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp26Q99MX1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp26Q99MX1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp26Q99MX1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp26Q99MX1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp26Q99MX1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp26Q99MX1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp26Q99MX1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms