Protein–RNA interactions for Protein: Q99MT2

Msh4, MutS protein homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh4Q99MT2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msh4Q99MT2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msh4Q99MT2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh4Q99MT2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Msh4Q99MT2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh4Q99MT2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh4Q99MT2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh4Q99MT2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh4Q99MT2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msh4Q99MT2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh4Q99MT2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msh4Q99MT2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh4Q99MT2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh4Q99MT2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Msh4Q99MT2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msh4Q99MT2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Msh4Q99MT2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msh4Q99MT2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msh4Q99MT2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms