Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dnajb11Q99KV1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dnajb11Q99KV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dnajb11Q99KV1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb11Q99KV1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb11Q99KV1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajb11Q99KV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnajb11Q99KV1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb11Q99KV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb11Q99KV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb11Q99KV1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms