Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf11Q99JX1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf11Q99JX1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf11Q99JX1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf11Q99JX1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf11Q99JX1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf11Q99JX1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf11Q99JX1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf11Q99JX1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Taf11Q99JX1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Taf11Q99JX1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Taf11Q99JX1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Taf11Q99JX1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Taf11Q99JX1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms