Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms