Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tlcd1Q99JT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tlcd1Q99JT6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tlcd1Q99JT6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tlcd1Q99JT6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tlcd1Q99JT6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tlcd1Q99JT6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tlcd1Q99JT6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tlcd1Q99JT6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tlcd1Q99JT6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tlcd1Q99JT6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms