Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psip1Q99JF8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psip1Q99JF8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Psip1Q99JF8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psip1Q99JF8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psip1Q99JF8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psip1Q99JF8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psip1Q99JF8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psip1Q99JF8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms