Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atad3Q925I1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atad3Q925I1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad3Q925I1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad3Q925I1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atad3Q925I1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad3Q925I1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atad3Q925I1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atad3Q925I1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Atad3Q925I1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atad3Q925I1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atad3Q925I1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atad3Q925I1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atad3Q925I1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atad3Q925I1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atad3Q925I1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atad3Q925I1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atad3Q925I1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atad3Q925I1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atad3Q925I1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms