Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sntg1Q925E1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sntg1Q925E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sntg1Q925E1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sntg1Q925E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sntg1Q925E1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sntg1Q925E1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sntg1Q925E1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sntg1Q925E1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms