Protein–RNA interactions for Protein: Q924N4

Slc12a6, Solute carrier family 12 member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a6Q924N4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc12a6Q924N4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc12a6Q924N4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc12a6Q924N4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc12a6Q924N4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc12a6Q924N4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Slc12a6Q924N4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc12a6Q924N4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc12a6Q924N4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc12a6Q924N4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slc12a6Q924N4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc12a6Q924N4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc12a6Q924N4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc12a6Q924N4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slc12a6Q924N4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms