Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sf3b5Q923D4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sf3b5Q923D4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sf3b5Q923D4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b5Q923D4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sf3b5Q923D4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sf3b5Q923D4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sf3b5Q923D4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b5Q923D4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b5Q923D4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms