Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NelfcdQ922L6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NelfcdQ922L6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NelfcdQ922L6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NelfcdQ922L6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NelfcdQ922L6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NelfcdQ922L6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NelfcdQ922L6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NelfcdQ922L6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NelfcdQ922L6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NelfcdQ922L6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NelfcdQ922L6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NelfcdQ922L6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NelfcdQ922L6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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