Protein–RNA interactions for Protein: Q922J6

Tspan2, Tetraspanin-2, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan2Q922J6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tspan2Q922J6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan2Q922J6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tspan2Q922J6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan2Q922J6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan2Q922J6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tspan2Q922J6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan2Q922J6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tspan2Q922J6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan2Q922J6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan2Q922J6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan2Q922J6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan2Q922J6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan2Q922J6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan2Q922J6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms