Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smc1bQ920F6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smc1bQ920F6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Smc1bQ920F6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Smc1bQ920F6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smc1bQ920F6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Smc1bQ920F6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smc1bQ920F6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smc1bQ920F6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smc1bQ920F6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Smc1bQ920F6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smc1bQ920F6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Smc1bQ920F6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Smc1bQ920F6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smc1bQ920F6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Smc1bQ920F6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Smc1bQ920F6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smc1bQ920F6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Smc1bQ920F6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Smc1bQ920F6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smc1bQ920F6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smc1bQ920F6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Smc1bQ920F6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smc1bQ920F6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smc1bQ920F6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smc1bQ920F6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smc1bQ920F6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smc1bQ920F6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smc1bQ920F6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smc1bQ920F6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smc1bQ920F6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smc1bQ920F6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smc1bQ920F6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smc1bQ920F6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smc1bQ920F6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Smc1bQ920F6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smc1bQ920F6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smc1bQ920F6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Smc1bQ920F6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smc1bQ920F6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smc1bQ920F6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Smc1bQ920F6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Smc1bQ920F6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Smc1bQ920F6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Smc1bQ920F6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smc1bQ920F6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smc1bQ920F6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smc1bQ920F6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms