Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med28Q920D3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med28Q920D3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Med28Q920D3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med28Q920D3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med28Q920D3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med28Q920D3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med28Q920D3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med28Q920D3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med28Q920D3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Med28Q920D3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med28Q920D3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med28Q920D3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med28Q920D3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms