Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Synpo2Q91YE8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Synpo2Q91YE8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Synpo2Q91YE8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Synpo2Q91YE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Synpo2Q91YE8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Synpo2Q91YE8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Synpo2Q91YE8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Synpo2Q91YE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Synpo2Q91YE8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Synpo2Q91YE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Synpo2Q91YE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Synpo2Q91YE8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Synpo2Q91YE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Synpo2Q91YE8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms