Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD6

Vill, Villin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VillQ91YD6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VillQ91YD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VillQ91YD6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VillQ91YD6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VillQ91YD6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
VillQ91YD6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VillQ91YD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VillQ91YD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VillQ91YD6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VillQ91YD6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VillQ91YD6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VillQ91YD6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VillQ91YD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VillQ91YD6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VillQ91YD6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VillQ91YD6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VillQ91YD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VillQ91YD6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VillQ91YD6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VillQ91YD6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VillQ91YD6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VillQ91YD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VillQ91YD6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VillQ91YD6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms