Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lims2Q91XD2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lims2Q91XD2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lims2Q91XD2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lims2Q91XD2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lims2Q91XD2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lims2Q91XD2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lims2Q91XD2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lims2Q91XD2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lims2Q91XD2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lims2Q91XD2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lims2Q91XD2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lims2Q91XD2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lims2Q91XD2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lims2Q91XD2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lims2Q91XD2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms