Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx15Q91WE1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx15Q91WE1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx15Q91WE1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx15Q91WE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx15Q91WE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx15Q91WE1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx15Q91WE1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx15Q91WE1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx15Q91WE1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms