Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Acsl6Q91WC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Acsl6Q91WC3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Acsl6Q91WC3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Acsl6Q91WC3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acsl6Q91WC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Acsl6Q91WC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Acsl6Q91WC3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Acsl6Q91WC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Acsl6Q91WC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Acsl6Q91WC3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Acsl6Q91WC3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Acsl6Q91WC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Acsl6Q91WC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acsl6Q91WC3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Acsl6Q91WC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acsl6Q91WC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acsl6Q91WC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acsl6Q91WC3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acsl6Q91WC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acsl6Q91WC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acsl6Q91WC3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acsl6Q91WC3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acsl6Q91WC3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acsl6Q91WC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms