Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac11Q91WA3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac11Q91WA3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac11Q91WA3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hdac11Q91WA3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hdac11Q91WA3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hdac11Q91WA3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac11Q91WA3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac11Q91WA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms