Protein–RNA interactions for Protein: Q91W29

Cox4i2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i2Q91W29 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cox4i2Q91W29 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cox4i2Q91W29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cox4i2Q91W29 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cox4i2Q91W29 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cox4i2Q91W29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cox4i2Q91W29 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cox4i2Q91W29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cox4i2Q91W29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cox4i2Q91W29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cox4i2Q91W29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms