Protein–RNA interactions for Protein: Q91V48

Pcdhb21, MCG1033322, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb21Q91V48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb21Q91V48 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdhb21Q91V48 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb21Q91V48 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdhb21Q91V48 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdhb21Q91V48 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcdhb21Q91V48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb21Q91V48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdhb21Q91V48 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdhb21Q91V48 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdhb21Q91V48 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdhb21Q91V48 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdhb21Q91V48 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdhb21Q91V48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms