Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE49

Duoxa1, Dual oxidase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Duoxa1Q8VE49 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Duoxa1Q8VE49 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Duoxa1Q8VE49 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Duoxa1Q8VE49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Duoxa1Q8VE49 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Duoxa1Q8VE49 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Duoxa1Q8VE49 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Duoxa1Q8VE49 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Duoxa1Q8VE49 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Duoxa1Q8VE49 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Duoxa1Q8VE49 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms