Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Apol9aQ8VDU3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol9aQ8VDU3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apol9aQ8VDU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apol9aQ8VDU3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apol9aQ8VDU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apol9aQ8VDU3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apol9aQ8VDU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol9aQ8VDU3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol9aQ8VDU3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apol9aQ8VDU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apol9aQ8VDU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apol9aQ8VDU3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apol9aQ8VDU3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms