Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ6

Sgsm3, Small G protein signaling modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm3Q8VCZ6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgsm3Q8VCZ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgsm3Q8VCZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgsm3Q8VCZ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sgsm3Q8VCZ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Sgsm3Q8VCZ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sgsm3Q8VCZ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm3Q8VCZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm3Q8VCZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms