Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ3

Nrbf2, Nuclear receptor-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbf2Q8VCQ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrbf2Q8VCQ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms