Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ3

Nrbf2, Nuclear receptor-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbf2Q8VCQ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrbf2Q8VCQ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrbf2Q8VCQ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nrbf2Q8VCQ3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrbf2Q8VCQ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrbf2Q8VCQ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrbf2Q8VCQ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nrbf2Q8VCQ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nrbf2Q8VCQ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nrbf2Q8VCQ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms