Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Agr3Q8R3W7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Agr3Q8R3W7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Agr3Q8R3W7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Agr3Q8R3W7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Agr3Q8R3W7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Agr3Q8R3W7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Agr3Q8R3W7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Agr3Q8R3W7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Agr3Q8R3W7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Agr3Q8R3W7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Agr3Q8R3W7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Agr3Q8R3W7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.6 ms