Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc12Q8R344 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc12Q8R344 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc12Q8R344 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc12Q8R344 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc12Q8R344 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc12Q8R344 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc12Q8R344 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc12Q8R344 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc12Q8R344 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc12Q8R344 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc12Q8R344 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc12Q8R344 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc12Q8R344 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc12Q8R344 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms