Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gtf3c5Q8R2T8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gtf3c5Q8R2T8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf3c5Q8R2T8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gtf3c5Q8R2T8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gtf3c5Q8R2T8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gtf3c5Q8R2T8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c5Q8R2T8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c5Q8R2T8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Gtf3c5Q8R2T8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf3c5Q8R2T8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gtf3c5Q8R2T8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Gtf3c5Q8R2T8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf3c5Q8R2T8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Gtf3c5Q8R2T8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gtf3c5Q8R2T8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gtf3c5Q8R2T8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf3c5Q8R2T8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf3c5Q8R2T8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf3c5Q8R2T8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gtf3c5Q8R2T8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gtf3c5Q8R2T8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms